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effect)11.噬菌体(phage)12.发夹结构(hairpin structure)13.DNA 的熔解温度(melting temperature Tm)14.分子杂交(molecular hybridization)15.环化核苷酸(cyclic nucleotide)第三章 酶与辅酶1.米氏常数(Km 值)2.底物专一性(substrate specificity)3.辅基(prosthetic group)4.单体酶(monomeric enzyme)5.寡聚酶(oligomeric enzyme)6.多酶体系(multienzyme system)7.激活剂(activator)8.抑制剂(inhibitor inhibiton)9.变构酶(allosteric enzyme)10.同工酶(isozyme)11.诱导酶(induced enzyme)12.酶原(zymogen)13.酶的比活力(enzymatic compare energy)14.活性中心(active center)第四章 生物氧化与氧化磷酸化1. 生物氧化(biological oxidation)2. 呼吸链(respiratory chain)3. 氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)4. 磷氧比P/O(P/O)5. 底物水平磷酸化(substrate level phosphorylation)6. 能荷(energy charg第五章 糖 代 谢1.糖异生(glycogenolysis)2.Q 酶(Q-enzyme)3.乳酸循环(lactate cycle)4.发酵(fermentation)5.变构调节(allosteric regulation)6.糖酵解途径(glycolytic pathway)7.糖的有氧氧化(aerobic oxidation)8.肝糖原分解(glycogenolysis)9.磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)10.D-酶(D-enzyme)11.糖核苷酸(sugar-nucleotide)第六章 脂类代谢1. 必需脂肪酸(essential fatty acid)2. 脂肪酸的α-氧化(α- oxidation)3. 脂肪酸的β-氧化(β- oxidation)4. 脂肪酸的ω-氧化(ω- oxidation)5. 乙醛酸循环(glyoxylate cycle)6. 柠檬酸穿梭(citriate shuttle)7. 乙酰CoA 羧化酶系(acetyl-CoA carnoxylase)8. 脂肪酸合成酶系统(fatty acid synthase system)第八章 含氮化合物代谢1.蛋白酶(Proteinase)2.肽酶(Peptidase)3.氮平衡(Nitrogen balance)4.生物固氮(Biological nitrogen fixation)5.硝酸还原作用(Nitrate reduction)6.氨的同化(Incorporation of ammonium ions into organic molecules)7.转氨作用(Transamination)8.尿素循环(Urea cycle)9.生糖氨基酸(Glucogenic amino acid)10.生酮氨基酸(Ketogenic amino acid)11.核酸酶(Nuclease)12.限制性核酸内切酶(Restriction endonuclease)13.氨基蝶呤(Aminopterin)14.一碳单位(One carbon unit)第九章 核酸的生物合成1.半保留复制(semiconservative replication)2.不对称转录(asymmetric trancription)3.逆转录(reverse transcription)4.冈崎片段(Okazaki fragment)5.复制叉(replication fork)6.领头链(leading strand)7.随后链(lagging strand)8.有意义链(sense strand)9.光复活(photoreactivation)10.重组修复(recombination repair)11.内含子(intron)12.外显子(exon)13.基因载体(genonic vector)14.质粒(plasmid)第十一章 代谢调节1.诱导酶(Inducible enzyme)2.标兵酶(Pacemaker enzyme)3.操纵子(Operon)4.衰减子(Attenuator)5.阻遏物(Repressor)6.辅阻遏物(Corepressor)7.降解物基因活化蛋白(Catabolic gene activator protein)8.腺苷酸环化酶(Adenylate cyclase)9.共价修饰(Covalent modification)10.级联系统(Cascade system)11.反馈抑制(Feedback inhibition)12.交叉调节(Cross regulation)13.前馈激活(Feedforward activation)14.钙调蛋白(Calmodulin)第十二章 蛋白质的生物合成1.密码子(codon)2.反义密码子(synonymous codon)3.反密码子(anticodon)4.变偶假说(wobble hypothesis)5.移码突变(frameshift mutant)6.氨基酸同功受体(isoacceptor)7.反义RNA(antisense RNA)8.信号肽(signal peptide)9.简并密码(degenerate code)10.核糖体(ribosome)11.多核糖体(poly some)12.氨酰基部位(aminoacyl site)13.肽酰基部位(peptidy site)14.肽基转移酶(peptidyl transferase)15.氨酰- tRNA 合成酶(amino acy-tRNA synthetase)16.蛋白质折叠(protein folding)17.核蛋白体循环(polyribosome)18.锌指(zine finger)19.亮氨酸拉链(leucine zipper)20.顺式作用元件(cis-acting element)21.反式作用因子(trans-acting factor)22.螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)第一章 蛋白质1.两性离子:指在同一氨基酸分子上含有等量的正负两种电荷又称兼性离子或偶极离子2.必需氨基酸:指人体(和其它哺乳动物)自身不能合成机体又必需需要从饮食中获得的氨基酸3. 氨基酸的等电点:指氨基酸的正离子浓度和负离子浓度相等时的pH 值用符号pI表示4.稀有氨基酸:指存在于蛋白质中的20 种常见氨基酸以外的其它罕见氨基酸它们是正常氨基酸的衍生物5.非蛋白质氨基酸:指不存在于蛋白质分子中而以游离状态和结合状态存在于生物体的各种组织和细胞的氨基酸6.构型:指在立体异构体中不对称碳原子上相连的各原子或取代基团的空间排布构型的转变伴随着共价键的断裂和重新形成7.蛋白质的一级结构:指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序以及二硫键的位置8.构象:指有机分子中不改变共价键结构仅单键周围的原子旋转所产生的原子的空间排布一种构象改变为另一种构象时不涉及共价键的断裂和重新形成构象改变不会改变分子的光学活性9.蛋白质的二级结构:指在蛋白质分子中的局部区域内多肽链沿一定方向盘绕和折叠的方式10.结构域:指蛋白质多肽链在二级结构的基础上进一步卷曲折叠成几个相对独立的近似球形的组装体11.蛋白质的三级结构:指蛋白质在二级结构的基础上借助各种次级键卷曲折叠成特定的球状分子结构的构象12.氢键:指蛋白质在二级结构的基础上借助各种次级键卷曲折叠成特定的球状分子结构的构象13.蛋白质的四级结构:指多亚基蛋白质分子中各个具有三级结构的多肽链以适当方式聚合所呈现的三维结构14.离子键:带相反电荷的基团之间的静电引力也称为静电键或盐键15.超二级结构:指蛋白质分子中相邻的二级结构单位组合在一起所形成的有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体16.疏水键:非极性分子之间的一种弱的、非共价的相互作用如蛋白质分子中的疏水侧链避开水相而相互聚集而形成的作用力17.范德华力:中性原子之间通过瞬间静电相互作用产生的一种弱的分子间的力当两个原子之间的距离为它们的范德华半径之和时范德华力最强18.盐析:在蛋白质溶液中加入一定量的高浓度中性盐(如硫酸氨)使蛋白质溶解度降低并沉淀析出的现象称为盐析19.盐溶:在蛋白质溶液中加入少量中性盐使蛋白质溶解度增加的现象20.蛋白质的变性作用:蛋白质分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时次级键遭到破坏导致天然构象的破坏但其一级结构不发生改变21.蛋白质的复性:指在一定条件下变性的蛋白质分子恢复其原有的天然构象并恢复生物活性的现象22.蛋白质的沉淀作用:在外界因素影响下蛋白质分子失去水化膜或被中和其所带电荷导致溶解度降低从而使蛋白质变得不稳定而沉淀的现象称为蛋白质的沉淀作用23.凝胶电泳:以凝胶为介质在电场作用下分离蛋白质或核酸等分子的分离纯化技术24.层析:按照在移动相(可以是气体或液体)和固定相(可以是液体或固体)之间的分配比例将混合成分分开的技术第二章 核酸1. 单核苷酸(mononucleotide):核苷与磷酸缩合生成的磷酸酯称为单核苷酸2. 磷酸二酯键(phosphodiester bonds):单核苷酸中核苷的戊糖与磷酸的羟基之间形成的磷酸酯键3. 不对称比率(dissymmetry ratio):不同生物的碱基组成由很大的差异这可用不对称比率(A+T)/(G+C)示4. 碱基互补规律(complementary base pairing):在形成双螺旋结构的过程中由于各种碱基的大小与结构的不同使得碱基之间的互补配对只能在G…C(或C…G)和A…T(或T…A)之间进行这种碱基配对的规律就称为碱基配对规律(互补规律)5. 反密码子(anticodon):在tRNA 链上有三个特定的碱基组成一个密码子由这些反密码子按碱基配对原则识别mRNA 链上的密码子反密码子与密码子的方向相反6. 顺反子(cistron):基因功能的单位;一段染色体它是一种多肽链的密码;一种结构基因7. 核酸的变性、复性(denaturation、renaturation):当呈双螺旋结构的DNA 溶液缓慢加热时其中的氢键便断开双链DNA 便脱解为单链这叫做核酸的溶解或变性在适宜的温度下分散开的两条DNA 链可以完全重新结合成和原来一样的双股螺旋这个DNA 螺旋的重组过程称为复性8. 退火(annealing):当将双股链呈分散状态的DNA 溶液缓慢冷却时它们可以发生不同程度的重新结合而形成双链螺旋结构这现象称为退火9. 增色效应(hyper chromic effect):当DNA 从双螺旋结构变为单链的无规则卷曲状态时它在260nm 处的吸收便增加这叫增色效应10. 减色效应(hypo chromic effect):DNA 在260nm 处的光密度比在DNA 分子中的各个碱基在260nm 处吸收的光密度的总和小得多(约少35%~40%), 这现象称为减色效应11. 噬菌体(phage):一种病毒它可破坏细菌并在其中繁殖也叫细菌的病毒12. 发夹结构(hairpin structure):RNA 是单链线形分子只有局部区域为双链结构这些结构是由于RNA 单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇形成氢键结合而成的称为发夹结构13. DNA 的熔解温度(Tm 值):引起DNA 发生熔解的温度变化范围只不过几度这个温度变化范围的中点称为熔解温度(Tm)14. 分子杂交(molecular hybridization):不同的DNA 片段之间DNA 片段与RNA 片段之间如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性形成新的双螺旋结构这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交15. 环化核苷酸(cyclic nucleotide):单核苷酸中的磷酸基分别与戊糖的3’-OH 及5’-OH形成酯键这种磷酸内酯的结构称为环化核苷酸第三章 酶与辅酶1.米氏常数(Km 值):用Km 值表示是酶的一个重要参数Km 值是酶反应速度(V)达到最大反应速度(Vmax)一半时底物的浓度(单位M 或mM)米氏常数是酶的特征常数只与酶的性质有关不受底物浓度和酶浓度的影响2.底物专一性:酶的专一性是指酶对底物及其催化反应的严格选择性通常酶只能催化一种化学反应或一类相似的反应不同的酶具有不同程度的专一性酶的专一性可分为三种类型:绝对专一性、相对专一性、立体专一性3.辅基:酶的辅因子或结合蛋白质的非蛋白部分与酶或蛋白质结合得非常紧密用透析法不能除去4.单体酶:只有一条多肽链的酶称为单体酶它们不能解离为更小的单位分子量为13,000——35,0005.寡聚酶:有几个或多个亚基组成的酶称为寡聚酶寡聚酶中的亚基可以是相同的也可以是不同的亚基间以非共价键结合容易为酸碱高浓度的盐或其它的变性剂分离寡聚酶的分子量从35 000 到几百万6.多酶体系:由几个酶彼此嵌合形成的复合体称为多酶体系多酶复合体有利于细胞中一系列反应的连续进行以提高酶的催化效率同时便于机体对酶的调控多酶复合体的分子量都在几百万以上7.激活剂:凡是能提高酶活性的物质都称激活剂其中大部分是离子或简单的有机化合物8.抑制剂:能使酶的必需基团或酶活性部位中的基团的化学性质改变而降低酶的催化活性甚至使酶的催化活性完全丧失的物质9.变构酶:或称别构酶是代谢过程中的关键酶它的催化活性受其三维结构中的构象变化的调节10.同工酶:是指有机体内能够催化同一种化学反应但其酶蛋白本身的分子结构组成却有所不同的一组酶11.诱导酶:是指当细胞中加入特定诱导物后诱导产生的酶它的含量在诱导物存在下显著增高这种诱导物往往是该酶底物的类似物或底物本身12.酶原:酶的无活性前体通常在有限度的蛋白质水解作用后转变为具有活性的酶13.酶的比活力:比活力是指每毫克蛋白质所具有的活力单位数可以用下式表示:活力单位数 比活力= 蛋白质量(mg)14.活性中心:酶分子中直接与底物结合并催化底物发生化学反应的部位称为酶的活性中心第四章 生物氧化与氧化磷酸化1. 生物氧化: 生物体内有机物质氧化而产生大量能量的过程称为生物氧化生物氧化在细胞内进行氧化过程消耗氧放出二氧化碳和水所以有时也称之为细胞呼吸或细胞氧化生物氧化包括:有机碳氧化变成CO2;底物氧化脱氢、氢及电子通过呼吸链传递、分子氧与传递的氢结成水;在有机物被氧化成CO2 和H2O的同时释放的能量使ADP 转变成ATP2. 呼吸链:有机物在生物体内氧化过程中所脱下的氢原子经过一系列有严格排列顺序的传递体组成的传递体系进行传递最终与氧结合生成水这样的电子或氢原子的传递体系称为呼吸链或电子传递链电子在逐步的传递过程中释放出能量被用于合成ATP以作为生物体的能量来源3. 氧化磷酸化:在底物脱氢被氧化时电子或氢原子在呼吸链上的传递过程中伴随ADP 磷酸化生成ATP 的作用称为氧化磷酸化氧化磷酸化是生物体内的糖、脂肪、蛋白质氧化分解合成ATP 的主要方式4、磷氧比:电子经过呼吸链的传递作用最终与氧结合生成水在此过程中所释放的能量用于ADP 磷酸化生成ATP经此过程消耗一个原子的氧所要消耗的无机磷酸的分子数(也是生成ATP 的分子数)称为磷氧比值(P/O)如NADH 的磷氧比值是3FADH2 的磷氧比值是25. 底物水平磷酸化:在底物被氧化的过程中底物分子内部能量重新分布产生高能磷酸键(或高能硫酯键)由此高能键提供能量使ADP(或GDP)磷酸化生成ATP(或GTP)的过程称为底物水平磷酸化此过程与呼吸链的作用无关以底物水平磷酸化方式只产生少量ATP如在糖酵解(EMP)的过程中3-磷酸甘油醛脱氢后产生的1,3-二磷酸甘油酸在磷酸甘油激酶催化下形成ATP 的反应以及在2-磷酸甘油酸脱水后产生的磷酸烯醇式丙酮酸在丙酮酸激酶催化形成ATP 的反应均属底物水平的磷酸化反应另外在三羧酸环(TCA)中也有一步反应属底物水平磷酸化反应如α-酮戊二酸经氧化脱羧后生成高能化合物琥珀酰~CoA其高能硫酯键在琥珀酰CoA 合成酶的催化下转移给GDP 生成GTP然后在核苷二磷酸激酶作用下GTP 又将末端的高能磷酸根转给ADP 生成ATP6.能荷:能荷是细胞中高能磷酸状态的一种数量上的衡量能荷大小可以说明生物体中ATP-ADP-AMP 系统的能量状态能荷=[ATP]+12 [ADP][ATP]+[ADP]+[AMP]第五章 糖 代 谢1.糖异生:非糖物质(如丙酮酸乳酸甘油生糖氨基酸等)转变为葡萄糖的过程2.Q 酶:Q 酶是参与支链淀粉合成的酶功能是在直链淀粉分子上催化合成(α-16)糖苷键形成支链淀粉3.乳酸循环乳:酸循环是指肌肉缺氧时产生大量乳酸大部分经血液运到肝脏通过糖异生作用肝糖原或葡萄糖补充血糖血糖可再被肌肉利用这样形成的循环称乳酸循环4.发酵:厌氧有机体把糖酵解生成NADH 中的氢交给丙酮酸脱羧后的产物乙醛使之生成乙醇的过程称之为酒精发酵如果将氢交给病酮酸丙生成乳酸则叫乳酸发酵5.变构调节:变构调节是指某些调节物能与酶的调节部位结合使酶分子的构象发生改变从而改变酶的活性称酶的变构调节6.糖酵解途径:糖酵解途径指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段是体内糖代谢最主要途径7.糖的有氧氧化:糖的有氧氧化指葡萄糖或糖原在有氧条件下氧化成水和二氧化碳的过程是糖氧化的主要方式8.肝糖原分解:肝糖原分解指肝糖原分解为葡萄糖的过程9.磷酸戊糖途径:磷酸戊糖途径指机体某些组织(如肝、脂肪组织等)以6-磷酸葡萄糖为起始物在6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸进而代谢生成磷酸戊糖为中间代谢物的过程又称为磷酸已糖旁路10.D-酶:一种糖苷转移酶作用于α-14 糖苷键将一个麦芽多糖的片段转移到葡萄糖、麦芽糖或其它多糖上11.糖核苷酸:单糖与核苷酸通过磷酸酯键结合的化合物是双糖和多糖合成中单糖的活化形式与供体第六章 脂类代谢1.必需脂肪酸:为人体生长所必需但有不能自身合成必须从事物中摄取的脂肪酸在脂肪中有三种脂肪酸是人体所必需的即亚油酸亚麻酸花生四烯酸2.α-氧化:α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游离脂肪酸作为底物有分子氧间接参与经脂肪酸过氧化物酶催化作用由α碳原子开始氧化氧化产物是D-α-羟脂肪酸或少一个碳原子的脂肪酸3. 脂肪酸的β-氧化:脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下在α碳原子和β碳原子之间断裂β碳原子氧化成羧基生成含2个碳原子的乙酰CoA 和比原来少2 个碳原子的脂肪酸4. 脂肪酸ω-氧化:ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在远离羧基的烷基末端碳原子被氧化成羟基再进一步氧化而成为羧基生成α,ω-二羧酸的过程5. 乙醛酸循环:一种被修改的柠檬酸循环在其异柠檬酸和苹果酸之间反应顺序有改变以及乙酸是用作能量和中间物的一个来源某些植物和微生物体内有此循环他需要二分子乙酰辅酶A的参与;并导致一分子琥珀酸的合成6. 柠檬酸穿梭:就是线粒体内的乙酰CoA 与草酰乙酸缩合成柠檬酸然后经内膜上的三羧酸载体运至胞液中在柠檬酸裂解酶催化下需消耗ATP 将柠檬酸裂解回草酰乙酸和后者就可用于脂肪酸合成而草酰乙酸经还原后再氧化脱羧成丙酮酸丙酮酸经内膜载体运回线粒体在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸这样就可又一次参与转运乙酰CoA 的循环7.乙酰CoA 羧化酶系:大肠杆菌乙酰CoA 羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白(BCCP)和转羧基酶三种组份它们共同作用催化乙酰CoA 的羧化反应生成丙二酸单酰-CoA8.脂肪酸合酶系统:脂肪酸合酶系统包括酰基载体蛋白(ACP)和6 种酶它们分别是:乙酰转酰酶;丙二酸单酰转酰酶;β-酮脂酰ACP 合成酶;β-酮脂酰ACP 还原酶;β-羟;脂酰ACP 脱水酶;烯脂酰ACP 还原酶第八章 含氮化合物代谢1.蛋白酶:以称肽链内切酶(Endopeptidase)作用于多肽链内部的肽键生成较原来含氨基酸数少的肽段不同来源的蛋白酶水解专一性不同2.肽酶:只作用于多肽链的末端根据专一性不同可在多肽的N-端或C-端水解下氨基酸如氨肽酶、羧肽酶、二肽酶等3.氮平衡:正常人摄入的氮与排出氮达到平衡时的状态反应正常人的蛋白质代谢情况4.生物固氮:利用微生物中固氮酶的作用在常温常压条件下将大气中的氮还原为氨的过程(N2 + 3H2→ 2 NH3)5.硝酸还原作用:在硝酸还原酶和亚硝酸还原酶的催化下将硝态氮转变成氨态氮的过程植物体内硝酸还原作用主要在叶和根进行6.氨的同化:由生物固氮和硝酸还原作用产生的氨登录生物体后被转变为含氮有机化合物的过程7.转氨作用:在转氨酶的作用下把一种氨基酸上的氨基转移到α-酮酸上形成另一种氨基酸8.尿素循环:尿素循环也称鸟氨酸循环是将含氮化合物分解产生的氨转变成尿素的过程有解除氨毒害的作用9.生糖氨基酸:在分解过程中能转变成丙酮酸、α-酮戊二酸乙、琥珀酰辅酶A、延胡索酸和草酰乙酸的氨基酸称为生糖氨基酸10.生酮氨基酸:在分解过程中能转变成乙酰辅酶A 和乙酰乙酰辅酶A 的氨基酸称为生酮氨基酸11.核酸酶:作用于核酸分子中的磷酸二酯键的酶分解产物为寡核苷酸或核苷酸根据作用位置不同可分为核酸外切酶和核酸内切酶12.限制性核酸内切酶:能作用于核酸分子内部并对某些碱基顺序有专一性的核酸内切酶是基因工程中的重要工具酶13.氨基蝶呤:对嘌呤核苷酸的生物合成起竞争性抑制作用的化合物与四氢叶酸结构相似又称氨基叶酸14.一碳单位:仅含一个碳原子的基团如甲基(CH3-、亚甲基(CH2=)、次甲基(CH≡)、甲酰基(O=CH-)、亚氨甲基(HN=CH-)等一碳单位可来源于甘氨酸、苏氨酸、丝氨酸、组氨酸等氨基酸一碳单位的载体主要是四氢叶酸功能是参与生物分子的修饰第九章 核酸的生物合成1.半保留复制:双链DNA 的复制方式其中亲代链分离每一子代DNA 分子由一条亲代链和一条新合成的链组成2.不对称转录:转录通常只在DNA 的任一条链上进行这称为不对称转录3.逆转录:Temin 和Baltimore 各自发现在RNA 肿瘤病毒中含有RNA 指导的DNA 聚合酶才证明发生逆向转录即以RNA 为模板合成DNA4.冈崎片段:一组短的DNA 片段是在DNA 复制的起始阶段产生的随后又被连接酶连接形成较长的片段在大肠杆菌生长期间将细胞短时间地暴露在氚标记的胸腺嘧啶中就可证明冈崎片段的存在冈崎片段的发现为DNA 复制的科恩伯格机理提供了依据5.复制叉:复制DNA 分子的Y 形区域在此区域发生链的分离及新链的合成6.领头链:DNA 的双股链是反向平行的一条链是5/→3/方向另一条是3/→5/方向上述的起点处合成的领头链沿着亲代DNA 单链的3/→5/方向(亦即新合成的DNA沿5/→3/方向)不断延长所以领头链是连续的7.随后链:已知的DNA 聚合酶不能催化DNA 链朝3/→5/方向延长在两条亲代链起点的3/ 端一侧的DNA 链复制是不连续的而分为多个片段每段是朝5/→3/方向进行所以随后链是不连续的8.有意义链:即华森链华森——克里格型DNA 中在体内被转录的那股DNA 链简写为Wstrand9.光复活:将受紫外线照射而引起损伤的细菌用可见光照射大部分损伤细胞可以恢复这种可见光引起的修复过程就是光复活作用10.重组修复:这个过程是先进行复制再进行修复复制时子代DNA 链损伤的对应部位出现缺口这可通过分子重组从完整的母链上将一段相应的多核苷酸片段移至子链的缺口处然后再合成一段多核昔酸键来填补母链的缺口这个过程称为重组修复11.内含子:真核生物的mRNA 前体中除了贮存遗传序列外还存在非编码序列称为内含子12.外显子:真核生物的mRNA 前体中编码序列称为外显子13.基因载体:外源DNA 片段(目的基因)要登录受体细胞必须有一个适当的运载工具将带入细胞内并载着外源DNA 一起进行复制与表达这种运载工具称为载体14.质粒:是一种在细菌染色体以外的遗传单元一般由环形双链DNA 构成其大小从1—200Kb第十一章 代谢调节1. 诱导酶:由于诱导物的存在使原来关闭的基因开放从而引起某些酶的合成数量明显增加这样的酶称为诱导酶2. 标兵酶:在多酶促系列反应中受控制的部位通常是系列反应开头的酶这个酶一般是变构酶也称标兵酶3. 操纵子:在转录水平上控制基因表达的协调单位包括启动子(P)、操纵基因(O)和在功能上相关的几个结构基因4. 衰减子:位于结构基因上游前导区调节基因表达的功能单位前导区转录的前导RNA通过构象变化终止或减弱转录5. 阻遏物:由调节基因产生的一种变构蛋白当它与操纵基因结合时能够抑制转录的进行6. 辅阻遏物:能够与失活的阻碣蛋白结合并恢复阻遏蛋白与操纵基因结合能力的物质辅阻遏物一般是酶反应的产物7. 降解物基因活化蛋白:由调节基因产生的一种cAMP 受体蛋白当它与cAMP 结合时被激活并结合到启动子上促进转录进行是一种正调节作用8. 腺苷酸环化酶:催化ATP 焦磷酸裂解产生环腺苷酸(cAMP)的酶9. 共价修饰:某种小分子基团可以共价结合到被修饰酶的特定氨基酸残基上引起酶分子构象变化从而调节代谢的方向和速度10. 级联系统:在连锁代谢反应中一个酶被激活后连续地发生其它酶被激活导致原始调节信号的逐级放大这样的连锁代谢反应系统称为级联系统11. 反馈抑制:在代谢反应中反应产物对反应过程中起作用的酶产生的抑制作用12. 交叉调节:代谢产物不仅对本身的反应过程有反馈抑制作用而且可以控制另一代谢物在不同途径中的合成13. 前馈激活:在反应序列中前身物质对后面的酶起激活作用使反应向前进行14. 钙调蛋白:一种依赖于钙的蛋白激酶酶蛋白与钙结合引起酶分子构象变化调解酶的活性如磷酸化酶激酶是一种依赖于钙的蛋白激酶第十二章 蛋白质的生物合成1.密码子(codon):存在于信使RNA 中的三个相邻的核苷酸顺序是蛋白质合成中某一特定氨基酸的密码单位密码子确定哪一种氨基酸叁入蛋白质多肽链的特定位置上;共有64 个密码子,其中61 个是氨基酸的密码3 个是作为终止密码子2.同义密码子(synonym codon):为同一种氨基酸编码的几个密码子之一例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码3.反密码子(anticodon):在转移RNA 反密码子环中的三个核苷酸的序列在蛋白质合成中通过互补的碱基配对这部分结合到信使RNA 的特殊密码上4.变偶假说(Wobble hypothesis):克里克为解释tRNA 分子如何去识别不止一个密码子而提出的一种假说据此假说反密码子的前两个碱基(3ˊ端)按照碱基配对的一般规律与密码子的前两个(5ˊ端)碱基配对然而tRNA 反密码子中的第三个碱基在与密码子上3ˊ端的碱基形成氢键时则可有某种程度的变动使其有可能与几种不同的碱基配对5.移码突变(frame-shift mutation):一种突变其结果为导致核酸的核苷酸顺序之间的正常关系发生改变移码突变是由删去或插入一个核苷酸的点突变构成的在这种情况下突变点以前的密码子并不改变并将决定正确的氨基酸顺序;但突变点以后的所有密码子都将改变且将决定错误的氨基酸顺序6.氨基酸同功受体(isoacceptor):每一个氨基酸可以有多过一个tRNA 作为运载工具这些tRNA 称为该氨基酸同功受体7.反义RNA(antisense RNA):具有互补序列的RNA反义RNA 可以通过互补序列与特定的mRNA 相结合结合位置包括mRNA 结合核糖体的序列(SD 序列)和起始密码子AUG从而抑制mRNA 的翻译又称干扰mRNA 的互补RNA8. 信号肽(signal peptide): 信号肽假说认为编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N 末端带有疏水氨基酸残基的信号肽它被内质网膜上的受体识别并与之相结合信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔随即被位于腔表面的信号肽酶水解由于它的引导新生的多肽就能够通过内质网膜登录腔内最终被分泌到胞外翻译结束后核糖体亚基解聚、孔道消失内质网膜又恢复原先的脂双层结构9. 简并密码(degenerate codon):或称同义密码子(synonym codon)为同一种氨基酸编码几个密码子之一例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码10.核糖体(ribosome): 核糖体是很多亚细胞核蛋白颗粒中的一个由大约等量的RNA和蛋白质所组成是细胞内蛋白质合成的场所每个核糖核蛋白体在外形上近似圆形直径约为20nm由两个不相同的亚基组成这两个亚基通过镁离子和其它非共价键地结合在一起已证实有四类核糖核蛋白体(细菌、植物、动物和线粒体)它们以其单体的、亚单位的和核糖核蛋白体RNA 的沉降系数相区别细菌核蛋白体含有约50 个不同的蛋白质分子和3 个不同的RNA 分子小的亚单位含有约20个蛋白质分子和1 个RNA分子大的亚单位含有约30 个蛋白质分子和2 个RNA 分子核蛋白体有两个结合转移RNA 的部位(部位和部位)并且也能附上信使RNA简写为Rb11.多核糖体(polysome):在信使核糖核酸链上附着两个或更多的核糖体12.氨酰基部位(aminoacyl site):在蛋白质合成过程中登录的氨酰-tRNA结合在核蛋白体上的部位13.肽酰基部位(peptidy site):指在蛋白质合成过程中当下一个氨酰基转移RNA接到核糖核蛋白体的氨基部位时肽酰tRNA所在核蛋白体上的结合点14.肽基转移酶(peptidyl transferase):蛋白质合成中的一种酶它能催化正在增长的多肽链与下一个氨基酸之间形成肽键在细菌中此酶是50S 核糖核蛋白体亚单位中的蛋白质之一15.氨酰-tRNA 合成酶(amino acy-tRNA synthetase):催化氨基酸激活的偶联反应的酶先是一种氨基酸连接到AMP 生成一种氨酰腺苷酸然后连接到转移RNA 分子生成氨酰-tRNA 分子16.蛋白质折叠(protein folding):蛋白质的三维构象称为蛋白质的折叠是由蛋白质多肽链的氨基酸顺序所决定的不同的蛋白质有不同的氨基酸顺序也就各自按照一定的方式折叠而成该蛋白质独有的天然构象这个蛋白质折叠是在自然条件下自发进行的在生物体内条件下它是在热力学上最稳定的形式多肽链在核糖体上一面延长一面自发地折叠成其本身独有的构象当肽链终止延长并从核糖体上脱落时它也就折叠成天然的三维结构17.核蛋白体循环(polyribosome):是指已活化的氨基酸由tRNA转运到核蛋白体合成多肽链的过程18.锌指(zine finger):是调控转录的蛋白质因子中与DNA 结合的一种基元它由大约30 个氨基酸残基的肽段与锌螯合形成的指形结构锌以4 个配位键与肽链的Cys或His 残基结合指形突起的肽段含12-13 个氨基酸残基指形突起嵌入DNA 的大沟中由指形突起或其附近的某些氨基酸侧链与DNA 的碱基结合而实现蛋白质与DNA 的结合19.亮氨酸拉链(leucine zipper):这是真核生物转录调控蛋白与蛋白质及与DNA 结合的基元之一两个蛋白质分子近处C 端肽段各自形成两性α-螺旋α-螺旋的肽段每隔7 个氨基酸残基出现一个亮氨酸残基两个α-螺旋的疏水面互相靠拢两排亮氨酸残基疏水侧链排列成拉链状形成疏水键使蛋白质结合成二聚体α-螺旋的上游富含碱性氨基酸(Arg 、Lys)肽段借Arg 、Lys 侧链基团与DNA 的碱基互相结合而实现蛋白质与DNA 的特异结合20.顺式作用元件(cis-acting element):真核生物DNA 的转录启动子和增强子等序列合称顺式作用元件21.反式作用因子(trans-acting factor):调控转录的各种蛋白质因子总称反式作用因子22.螺旋环螺旋(helix-loop-helix):这种蛋白质基元由两个两性α—螺旋通过一个肽段连结形成螺旋—环—螺旋结构两个蛋白质通过两性螺旋的疏水面互相结合与DNA 的结合则依靠此基元附近的碱性氨基酸侧链基团与DNA 的碱基结合而实现

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    2024-10-23 11:28:54

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